履约保函的办理流程：企业提交资料，由担保公司审核，确认无误后，以公对公方式备注转账，收到款后资料提交银行出保函，所以履约保函的扣款是在企业资料提交到银行前，这也是银行的一项硬性规定，但因为转账方式是以公对公备注，并且保函出具后，也会出具相对应的发票、收据，并签订双方合同。

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